با سلام.
صرف نظر از موقوفه بودن ملک .اگر شهرداری طرح خاصی را اجراء کرده باشد شما ابتدا باید از طرح مطروحه مطلع شوید. برای اجرای طرح های شهری باید حق و حقوق مالکین پرداخت شود. بهتر است نسبت به تصرف شهرداری اقدام قانونی انجام دهید.البته میتوانید با مراجعه به اداره اوقاف و اطلاع به آن اداره ،پیگیری را از آنجا هم بخواهید.