بر اساس قوانین و مقررات مرتبط با فرایند تغییر جنسیت در ایران، مراحل مشاوره و ارزیابی روانشناختی و پزشکی بخشی جدایی‌ناپذیر از فرایند اخذ مجوز تغییر جنسیت است. این مراحل تحت نظارت پزشکی قانونی و براساس آیین‌نامه‌های وزارت بهداشت و درمان است. عدم تکمیل به موقع یا تعمدی این مراحل ممکن است باعث تأخیر در صدور مجوز شود. با این حال، این وضعیت می‌تواند با ارائه توضیحات و اسناد معتبر به شورای پزشکی قانونی مجدداً بررسی گردد. عدم اخذ مجوز عمدتاً به دلیل عدم تطابق شرایط لازم با معیارهای پزشکی و روانشناختی است،