باسلام ،در فرضی که دکان جزو همان حیاط/خانه و متصل به بنا بوده و سند یا حدّ جداگانهای نداشته، ظاهر امر به نفع پدر شماست. عبارت «با تمام متعلقات» لزوماً نیاز ندارد نام دکان را جداگانه ببرد.طبق ماده ۳۵۶ قانون مدنی، هرچه عرفاً جزء یا تابع مبیع باشد، اگر صریحاً در قرارداد نام نبرده باشند،داخل معامله است. همچنین در فروش خانه، آنچه به بنا متصل است اصولاً متعلق به خریدار است، مگر صریحاً استثنا شده باشد (ماده ۳۵۸ قانون مدنی).
سلام با توجه به اظهارات شما، مورد معامله بر اساس مفاد قرارداد تعیین خواهد شد با توجه به توضیحات شما ، مغازه جز خانه ی مورد معامله محسوب نخواهد شد مگر به صورت صریح در قرارداد مبایعه نامه ، مغازه جزء مورد معامله ذکر شده باشد