بله، وجود کانال قنات در زمین مانع ساخت و ساز است مگر اینکه با اخذ مجوز از سازمان آب و وزارت نیرو و تغییر مسیر آن، حریم قنات رعایت شود.
برای اقدام، ابتدا از امور آب منطقه استعلام کرده و در صورت امکان، نسبت به انتقال یا پر کردن کانال با تأیید کارشناس رسمی اقدام کنید.