متاسفانه در قوانین ما به افراد مبتلا به این اختلال و وضعیت حقوقی آنها قبل و بعد از تغییر جنسیت اشاره ای نشده است و مسائل حقوقی مانند وضعیت ازدواج قبلی در مورد تغییر جنسیت، سهم الارث و … مربوط به این افراد غیر واضح است.
و تنها در قانون حمایت خانواده مصوب 1391، دادگاه صالح برای رسیدگی به درخواست مجوز تغییر جنسیت، دادگاه خانواده است.
برای تغییر جنسیت باید موارد زیر را انجام داد:
مجوز تغییر جنسیت و عدم انتقال درخواست
لزوم اخذ مجوز لازم برای انجام این اقدام از دادگاه خانواده
اخذ نظریه پزشکی قانونی و بررسی وضعیت پس از بررسی توسط متقاضی توسط دادگاه
رای غیر مالی و قابل تجدید نظر
به دلیل ارتکاب عملی که از موارد کیفری ماده 638 قانون مجازات اسلامی امکان تعقیب شخصی پس از تغییر جنسیت است.