بر اساس قوانین و مقررات اداری و استخدامی کشور، هر دستگاه دولتی دارای آیین‌نامه‌ها و مقررات خاص خود در مورد رفتار و انضباط اداری است. وزارت دفاع جمهوری اسلامی ایران نیز به عنوان یک نهاد نظامی و امنیتی، مقررات و ضوابط خاصی را در زمینه انضباط اداری دنبال می‌کند. در خصوص روابط خارج از چهارچوب‌های تعریف‌شده، این وزارت می‌تواند بسته به مورد، واکنش‌های انضباطی نظیر توبیخ یا حتی اخراج را اعمال کند. به‌خصوص اگر این روابط به شأن و وظایف محوله آسیب برساند یا مغایر با اصول و ارزش‌های حاکم بر نهاد نظامی باشد، موضوع جدی‌تر بررسی خواهد شد. تصمیم نهایی براساس سیاست‌های داخلی وزارت و با توجه به جزئیات هر مورد اتخاذ می‌شود.